Mario eta Luigi anaiak ezkutuko mundu batera doaz Peach printzesa erreskatatzera, Bowser errege gaiztoak harrapatua. Gauzak, ordea, ez dira errazak izango. Mario eta Luigik perretxiko bizidun armada bati aurre egin beharko diote bere aurkariaren aurka borrokatu aurretik. Arrisku ugari dituzten adreilu eta gazteluen ibilbideak izango dira anaiek beren helburua lortzeko gainditu beharko dituzten oztopoetako batzuk.